掲示板過去ログ

昨日は会社の飲みがあったので、
四時で実験を切り上げました。

目的
プラスミドに目的遺伝子が入っているか
電気泳動で確認する。（インサートチェック）
試薬作りに励む

実験手順
1.電気泳動で流すサンプルを作る。
　第一のコース：色素付きマーカー（4μｌ）
　第二のコース：昨日切ったプラスミド（15μｌ）
　（これは37度から取り出したものに等量の
　　フェノールクロロホルムを入れて、ボルテックス
　　した後、遠心を五分間し上清15μｌを取ったもの。
　　不要なタンパクを除去するため、この作業が必要らしい）
　第三のコース：切ってないプラスミド（５μｌ）

　切ったものと切ってないものには、それぞれ6×ＤＮＡdyeを
　3、1μｌずつ入れて全て流しました。
　「6×」の意味を初めて知りました。

2.10分間（150Ｖ）流した後、暗闇の中ゲルの写真を撮りました。
　写真の撮り方は、手順が複雑で覚えられせんでした。
　
3.またまた、ＮＭＲの機械に液体窒素を入れました。

4.1ＭのＫＣＬ（100ｍｌ）、1ＭのＭｇＣＬ2（100ｍｌ）、
　ＲＮＡ部屋用の酢酸Ｎａ（ｐＨ5.2）（100ｍｌ）を作った
　後、オートクレーブしたっす。（昨日、オートくれーブし忘れた
　ものも、ちゃんとやりました。ついでにmilli Qも100ｍｌも
　オートくれーブしました）
　
5.終了
　
結果
・マーカーが薄くて見えなかったよ～
・6×dyeには2種類の色素（ＢＰＢ、ＸＣ）が
　入ってたため、一レーンにつき2種類のバンドが
　見えてたのかな？？でも今写真を見ると1種類しか
　バンドが見えてない・・なぜだろう）

考察
第三のレーンに比べて、第二のレーンは若干泳動度が
小さかった。これは切ってないプラスミド（環状ＤＮＡ）に比べ、
切ったプラスミド（リニアーＤＮＡ、直線ＤＮＡ）の方が
泳動しにくいからからかな・・・
というわけで、プラスミドに目的ＤＮＡがめでたく入って
たのでしょう。バンザイ。

課題
ＢＰＢとＸＣについて調べる（岡部さんに聞く）

感想
おやすみ

　
　

　

泳動中は色素がみえているだけで、
べつにそれはDNAを見ているわけではないっす。
ただ、どの辺まで流れたかなー、と確認する
だけだから。

XCとBPBは単純に荷電量の違いで泳動度が
違うのだと思う。あれらは単なる目安っすよ。

あっ、そっか！
あの暗室で見えたのは、
エチブロとＤＮＡの協奏曲によって
できあがったものだっけ？
Ｙ山研は、エチブロをゲル作成時に
入れるという荒技をいたします。

日々精進

がんばれー！

というか自分もやる気打算と阿寒。
今は「物理のやる気」がかくれんぼして2週間くらい見つかっていません。
「生物のやる気」は鬼ごっこして遙か彼方に消えていきそう。このままかくれんぼにシフト思想。まっずいなぁ。ちと疲れ気味だな。残りの連休は体と心を休めます。

連休あけたらロケットスタートだぁ

いや～しかし連休が取れてよかった。
連休前に岡部さんに
「連休も実験する？」と
聞かれたときは、びっくりしましたが・・・
まぁ、まだ難しいことやってるわけではないので
（毎日試薬作りに勤しんでおります）
実験も楽しいですが（笑）

連休明けたら、またビシビシ
試薬作るぞぉ！！！

最近ｐＨ調節が趣味になりつつあります。

マエダ先生がんばりましょう！！

昨日510氏と話してたんだけど
電気泳動前にエタ珍するのは必須なのかな？
学実ってそのままアプライしてたきがする。
あんまり覚えてないけど。
いや、制限酵素を除きたいのはわかるけど
なんか、そんなに気にするほどのことなのか
よくわかんなくて。もし気にすべきなんだったら
おれもこれからは気をつけようと思って。
ちょいと誰か教えて。

反応後即泳動なら別に必要ないと思います。つーか、してない。＞EtOH沈
即泳動出来ないときはheat deactivationしとけばいいでしょ。出来る酵素なら。

酔った勢いでまた書いちまったよ…。

これでいいのだぁ～

それでいいのだぁ～

ぼんぼん！ばかぼん！

ばかぼんぼん！！

ときに
しげっちは
ヌレキ研、坂本研？？

８日の七時頃から
Ｙ山研神官コンパがあるので
宜しく。

guys who will research at yamamoto lab this and next semester, should go to room 126 on next tuesday at 1:30 p.m.
i couldn't write in japanese (korean also).
if you couldn't understand my, perhaps odd, english, call me, in japanese of course..

rrrrrrr---
Now we are struggling in mid-term exam ...
rrrrrr----.
It's really tiring task!!!
rrrrrr----.
Someone help me-----!!!.
rrrrrr----.

caution!
Today's soccer game of
Japan vs honjuras(?) is 3-3!!
Shunsuke got two goals! One is
santosusu

ra ra ra
mujinnkunn

あのですね、学生実習室のパソコンで日本語を入力することができなかったので上のような書き込みになってしまいましたが大丈夫ですよね、山本研のみなさん。
連休明けの火曜日、午後一時半126号室集合ですよ。

もう二段落、論文を読む。

確率・統計のお勉強をする。

簿記三級の勉学を志す。

アメリカの失業率が約8年ぶりに
６％を超えたらしい・・

株価が下がる～～～～～～

とある人に生化の４年ですといったら
「あー、なまばけね」
と言われた。

なまばけなまばけ…
びみょー。

なんまいだーなんまいだー

一瞬、なまはげ　に見えた。

一昨日の掲示板の変更以後、
題名・名前・本文が「論文」、「お知らせ」、「すぎやま」などの特定の文字列のみからなる投稿に関して、文字コードの判定がうまくいかず文字化けしてしまうと言う不具合が発生していました。

とりあえず修正してみましたが、今後も何か発生するかもしれません（特に、携帯から投稿した場合）。

皆さんにはご迷惑をお掛けしました。

携帯用の部分に関しても文字化け対策をしました。

確証はありませんが、多分大丈夫なはずです。

昨日、この掲示板の文字コードセットをShift_JISからUTF-8に変更しました。
この作業の関係で、昨日の17時代と22時代にそれぞれ30分位ずつこの掲示板が使えなくなっていたはずです。
皆さんにはご迷惑をお掛けしてすいませんでした。

この変更により、日本語と一般的なアルファベット・記号以外の文字もある程度入力することができるようになりました。
ちょっと前に川村氏が頑張ってハングルを打ち込みましたが、これからはふつうにキーボードから入力するので良くなるはずです。
そのほか、SchrödingerとかAmpèreとかのアクセントも入力できたりします。

ただ、日本語以外の文字についてはOS・ブラウザによっては表示できないことがあります。
Windows系では、Internet Explorer(5.5以降)、Netscape 6、Mozilla(5.0)、Opera 6は大丈夫みたいですが、Netscape Communicator 4.xでは表示できません。
Macではどのブラウザもだめなようです（学生実験室のMacの場合）。
（Mac OS Xなら大丈夫かも？ Macは持っていないので何ともいえませんが）
Unix, Linuxはよく分かりませんが、とりあへずECCのNC, UnixのMozillaではちゃんと表示されました。
また、日本語以外の文字のフォントがインストールされていないと当然ですが表示されません。

まぁそんなわけでこれからもよろしく。

あと、ハングルを書き込むのはいいんだけど、読める人が少ないからといって変なことは書かんように。

みやざきくん本当にどうもありがとう。
いつもいろいろトラブルをおこして
しまってすいません。

田中氏、今度本当に東風荘で川村君を混ぜて、麻雀をうちまひょう。ちなみに、俺のハンドルネームは｢森の熊さん｣です。まかけたらよろしく。

안녕하세요

여렁분 잘 지내셨지요?

지금 시험 기간의 관게로
눈 코 뜰 새 없이 바빠요.

시험이 끝난 후에도 게속 바빨 것 같아서
마장할 틈도 없을 거에요.

그레서 제가 일본에 돌아간 후에 같이 하자!!!
그립기는 그리지만 잠울 수 있울 거에요....

여러분에게 하나님의 은종이 가득하시기를 바랍니다...

上の文字が読めない・・・

理物でみたら文字化けしてました。
ちゃんとでても自分には文字化けしてる
のとかわんないけどー。

元気そう？かな

おぉ、ハングルだ。
今度書き方教えて。
やっぱそっちはキリスト教が盛んなの？

ちなみに僕は

「ドラえもん！」

です

ちなみに僕は「hippocampus」です。
某ネット碁会所（ＨＮは英数字だけ）で使い始めてからヤフーなど他の所でもこれで通してます。
ギリシャ神話の怪物からとりました（？）。

えー上のハングルの内容は以下のようで
す。

｢みなさんこんにちわ。おげんきですか？えーと今試験中でかなりいそがしく、これからもいそがしそうなのでひとまず東風荘はできなさそうです。
また時間ができてきたられんらくします。｣

えー｢かきこみをみると川村が韓国にいる事を忘れてしまう｣というくれーむ（？）があったので、ハングルでかてみました。ところどころスペルミスなどがあるようですが。

＞ミスたーち
入力のしかたは適当に練習していればなれる、としか言いようがないんですが。
キリスト教は本当に多い。ある統計によると国民の４分の１がキリスト教とらしい。教会もでっかいのがあちこちにある。こんなかんじでーす。

というかですね、自分でコンピューターもってないのですが、それでも東風荘って登録とかできるの？
ひとまず、学校のＰＣルームに買ってに
ダウン道路だけしちゃったんだけど。。

今日は、まず実験ノートとプロトコルノートを
買うように指示されました。

目的
昨日と同じ。

実験手順
1.0.8％アガロースゲル（100ml）を作ることになる。
2.「アガロース何グラム必要でしょう？」
3.「0.8ｇ！！」
4.三角フラスコに1×ＴＡＥと共に混ぜて、電子レンジで溶かす。
5.フラスコにエチブロ1μを入れてから、型に流し込む。
6.6×ＤＮＡダイ10ｍｌ（50％グリセロース、0.03％ＢＰＢ、
　0.03％ＸＣ、30ｍＭＥＤＴＡ（ｐＨ8.0））を作る
　ことになる。ちなみにＢＰＢとは、ブロモフェノール
　ブルー、ＸＣとはキシレンシアノール。
7.まず0.5ＭＥＤＴＡ（ｐＨ8.0）100ｍＬを作ろう！
8.水に（ＥＤＴＡ．2Ｎａ）18.6ｇを溶かしたところ、
　全く溶ける気配を見せないので、岡部さんを呼ぶ。
9.岡部さんが大竹さんを呼ぶ。
10.ＮａＯＨの粒を入れながら、ｐＨ8.0に合わせて
　いくうちに溶ける。
11.そんで6×ＤＮＡダイを作った。
12.3Ｍ酢酸ナトリウム（ｐＨ5.2）100ｍｌを作るが
　　オートくれーブし忘れる。明日します。
13.ＲＮＡ部屋で0.8Ｍ　Ｈｅｐｅｓ－ＫＯＨ（ｐＨ8.1）を
　作るがこれもオートくれーブし忘れる。
14.二時間ほどＹ山研のセミナーに参加する。
15.なぜか今は、使われてないＮＭＲの機械に液体窒素を
　　入れる。そんでもって、ＮＭＲ室を掃除機かける。
　　論文をまだ二段落しか読んでないことを岡部さんに
　　正直にいう。計一時間かかる。
16.制限酵素反応をやることになる。なぜさっきゲルを
　作ったか理解する。
17.エッペンにmilli Q2.5μｌ、10×klB1.5μｌ、
　　プラスミド10μｌ、酵素（ＳｐｈⅠ）1μｌを入れて
　　混ぜ、37度でオーバーナイト。
18.終了。

感想
今日は、キセ君にかなり手伝ってもらったので
助かりました。ありがとう。
それにしても、四年生って夏休みないんだすね。
びっくらこきました。絶対、インシ休みとろう。

Dyeなんかつくってるんだ…
横山研金持ってるんじゃないのかな。
（O竹サン情報）
制限酵素買ったらついてこない？
0.5MEDTAも3MAcONaも出来合いのもの
使ってました。いちいち作るの面倒だシー。
杉さんはSOCも買ってるって言ってたYO

おらにはお金を使わなくていいんダス。
ぐすん

杉酸にこの掲示板を見せられたO竹です。
ちとツッコミを入れたくなってしまったので、一応４年生ということで
許容していただけると幸いです。

Dyeはついてくるしついてくるのを使っている人も居ますが
組成上の問題で作成した物の方が良いという人も多いので
作っている人も多いです。
XCとBPBのどっちかがよく見るバンドにかぶる人に多いようです。
あと念のため横山研は金持ちじゃないですよ、今は坂野研西郷研の方が
金あるような。

ＳＯＣは買ってないよ。既製品ではあるけども。
多分、業者から試供品をせしめたやつだろーと。

あ、上のは俺です。化けた。

SOCのパウダー安いし使用量なんか微々たるもんだから
買ってもいい気がするけどね
ちなみにかってにBIO101のを買って使ってます。
invitrogenやTAKARAのコンピについてくるのも使ってます。

言い忘れ、NMRに液窒入れるのは
入れないとクエンチして大変危険だからです。
落とすのは結構大変な作業らしいです、とはいえ
さっさと落として欲しいものです。
クエンチについてはこの辺でも見て下さい。
http://www.crc.u-tokyo.ac.jp/gyomu/publication/tayori/html/kobe.html

岡部さんも、
「窒素入れないと、爆発するのよ」
とおっしゃられていました。

ところでＳＯＣって
なんですか？？

参考になりました。
DyeでもたしかTOYOBOのにはXCが
入っていなかったような。
分離がわかりやすいように2つ入ってる
のを使ってる(つもり）ですが。
その辺の用途によりけりで使い分ける
ところがまだまだ未熟です。

SOCは形質転換効率上げるための
培地、というのが一般的か。>田中氏
いつぞやSOCにKClは必要か？
という話題で盛り上がっていたとき(?)
に杉さんが買ったとか買うとか言っていたような気がしたもので。
すいません。

結局LB培地で形質転換しても
あんまりかわんなかった。
劇的な違いはないにしても
少しは効率が落ちないかとよからぬ
期待を抱いていました。